Музей історії фармації був відкритий в 1966 році на базі старовинної аптеки. Аптека залишилася діючою і продовжує виробляти так зване «Залізне вино»
Аптека-музей розташована на площі Ринок у кутовому будинку, яким починаються вулиці Друкарська та Ставропігійська. Аптека в цьому будинку була заснована в 1735 році військовим фармацевтом магістром Наторпом і носила назву «Під чорним орлом».
Експозиція музею представлена більш ніж трьома тисячами експонатів в 16 залах загальною площею 700 кв.м. У торговій залі найцікавішим експонатом є фармацевтичні ваги. У другому залі раніше була кімната, де зберігалися запаси медикаментів, тепер тут виставлена колекція посуду для зберігання медикаментів, частина аптечного обладнання різних епох, старі патентовані ліки. Інтер’єр третьої зали відтворює старовинну аптечну лабораторію. Експозиція триватиме у флігелі, побудованому на рубежі XV і XVI століть. У ньому розмістилися алхімічна лабораторія, яка відтворена за старовинними картинами і гравюрами, а також бібліотека, яка налічує понад 3 тисячі книг. У старих аптечних підвалах відновлені інтер’єри початку XVIII століття, а у внутрішньому дворику реконструйований вигляд житлового будинку заможного міщанина XVI-XVII століть.